Nargile kömürü, nargile içiminde kullanılan önemli bir malzemedir. Genellikle hindistancevizi kabuğundan, odun veya bambudan üretilir. Kaliteli nargile kömürü, nargilenin tadını olumlu etkiler ve dumanın yoğunluğunu artırır. Doğru yakıldığında, uzun süre yanar ve stabil bir ısı sağlar, bu da tütünün eşit bir şekilde ısınmasını ve yanmasını sağlar. Böylece nargile seanslarının süresi uzar ve daha keyifli hale gelir.
Kömürün doğal ve katkısız olması, sağlık açısından daha güvenli kabul edilir. Ayrıca, düşük kül oranına sahip kömürler, temizliği kolaylaştırır ve tütünün tadını bozmaz. Nargile kömürünü yakarken, yüksek ısı veren elektrikli ısıtıcılar veya kömür çakmakları kullanılır. Doğru şekilde yakılmamış kömür, nargile keyfini olumsuz etkileyebilir, bu yüzden dikkatli olunması önemlidir. Nargile kömürü seçimi, nargile içim kalitesini doğrudan etkileyen bir faktördür.